Ночью в Токийском национальном институте микроорганизмов разворачивается таинственное нападение со стороны организации, которую называют Красные сиамские кошки. Преступники приводят в действие взрыв в засекреченной лаборатории, где якобы хранится опасный вирус с смертностью около 80 процентов и без лекарства на данный момент. Этот инцидент мгновенно заполняет газеты громкими заголовками, затмевая сообщение о грандиозной демонстрации крупнейшего в мире дирижабля, созданного под руководством Джирокичи Сузуки. К пригласительному письму на презентацию прилагается загадочная записка адресованная Кайто Киду — в ней ему предлагается украсть выставленную драгоценность под названием Леди Скай. Конану Эдогаве разрешают подняться на борт дирижабля вместе с Когоро Мори, Ран Мори, Соноко Сузуки, профессором Агасой и юным Детективным клубом. Но радость быстро сменяется тревогой: таинственный звонок сообщает, что вирус уже выпущен в курительной комнате, и гости начинают искать способы справиться с нарастающей болезнью. Внезапно на сцеплении событий появляется группа Красные сиамские кошки и захватывает дирижабль. Чтобы остановить злоумышленников, Конан и Кайто Кид объединяют силы с союзниками и начинают просчитывать каждую улику, пытаясь выяснить истинные цели загадочной группировки и их план до наступления фатального срока.
