Во время очередной поездки на автобусе Сакура Сакуракодзи замечает через окно странную сцену: люди словно охвачены синим пламенем и сгорают, а рядом стоит молодой человек, который остаётся невредимым. На следующий день она идёт к тому месту снова, но нигде не обнаруживает тел и никаких следов преступления. В тот же день в её школьный класс переводится новый ученик Рэй Огами, внешний облик которого точь в точь повторяет того yesterdayшнего парня, и он носит чёрную перчатку на левой руке. Рэй — так называемый «Код: Разрушитель» — человек, который, по слухам, «не существует» в обычной мире. По виду он кажется хладнокровным убийцей, который действует по принципам «око за око» и «зло против зла». Уверенная, что убийство — зло само по себе, Сакура намерена направить его на истинный путь и растопить его ледяное сердце.
