К югу от берегов Японии раскинулся остров Южного Креста, окутанный густой зеленью и скрывающий немало тайн. Однажды ночью на его побережье появляется юноша по имени Такуто Цунаси, выброшенный из Японии и прибывший без какого-либо багажа или плана на будущее. Он поступает в Старшую школу Южного Креста и сразу же привлекает внимание яркой, позитивной натурой, быстро находя общий язык со многими одноклассниками, включая Вако Агэмаки и Сугату Синдо. Но за стенами учебного заведения скрывается ещё одна история: под землёй спрятано множество гигантов, спящих и загадочных меха-устройств, которые зовут Кибоди. Обычные люди могут ими управлять лишь в параллельном измерении под названием Нулевое Время. Вскоре Такуто оказывается втянутым в противостояние с таинственной организацией «Мерцающий Звёздный Крест», стремящейся овладеть Кибоди и сломать печати четырёх священных девушек, которые служат препятствием для использования Кибоди вне Нулевого Времени...
