Обычный старшеклассник Аруто Кирихара увлечён историями об Алисе, рассказанными загадочным отшельником из параллельного мира — Альтернайтом Л. Тахионом. Однажды ночью, когда он дописывает собственную версию так называемой «третьей книги», над ним появляется девушка, летящая на фоне полной Луны, и она выглядит точь-в-точь как Алиса из его воображения. Аруто выбегает из дома и гонится за летающей фигурой, в итоге оказывается в библиотеке, где становится свидетелем её дуэли с другой девушкой в костюме. Так начинается его внезапное знакомство с миром Алисы — элитным клубом сверхсильных подростков, которые регулярно дерутся в Стране Чудес в другом измерении, чтобы украсть «скрытые истории» друг у друга. Собрав все сюжеты, они создадут легендарный третий том «Вечной Алисы», дарующий обладателю одно желание. Вероятно, это будет не Аруто, ведь он не может превратиться в волшебную девушку; возможно, это окажется его любящая младшая сестра Кириха Кирихара, или же девушка его мечты Арису Арисугава.
