На протяжении десятилетий Японию держат в напряжении гигантские монстры — кайдзю, которые возникают из ниоткуда и несут разрушение: они пожирают людей, рушат города и сеют хаос. Но наука и техника шагнули вперёд, благодаря чему появились элитные боевые отряды, готовые денно и нощно рисковать жизнью ради спасения граждан. В поддержку людей работают и клининговые команды, очищающие улицы от останков битвы и следов разрушения. 32-летний Кафка Хибино — профессиональный уборщик, который когда-то мечтал попасть в защитники. После нескольких провалов на отборе он смирился с ролью чистильщика и убедил себя, что так и должно быть. Однако новенький стажёр Рено Итикава ставит под сомнение его убеждения: недавно возрастной предел для боевых подразделений подняли до 33 лет, значит у Кафки появился единственный шанс стать защитником людей. Но этот шанс требует силы и здоровья, которых у него почти не осталось — и всё зависит от внутри найденной решимости. «Нашёл!» — сообщил мелкий летающий кайдзю и запрыгнул в его рот. Так Кафке, без подготовки, превращается в могучего человекоподобного кайдзю. За ним начинает охоту отряд защитников, а сам герой сталкивается с мучительной дилеммой: бежать и прятаться или принять роль в защитной стропе и стать частью тех, кто держит город от угрозы.
