В Мюнхене, в начале 1920-х, прошло уже два года с тех пор, как Эдвард Элрик оказался в чужом мире, оставив родину, друзей и брата Альфонса. Лишившийся своей алхимической силы, он продолжает жить и мечтать о возвращении домой, параллельно осваивая инженерное ремесло вместе с Альфонсом Хайдерихом — молодым человеком, чей облик почти неотличим от старшего брата. Несмотря на усердие и изобретательность, никаких практических результатов пока нет. Всё резко меняется, когда Эдвард выручает из беды цыганскую девушку. По стечению обстоятельств он оказывается вовлечён в цепь событий, способных разрушить баланс между двумя мирами. На стороне же в своей родной вселенной Альфонс Элрик углубляет исследования тайн алхимии, преследуя цель ещё раз встретиться с братом. События фильма «Стальной алхимик: Завоеватель Шамбалы» разворачиваются прямо на границе миров, где каждое решение может перерасти в глобальную катастрофу, и где дружба, смелость и наука сталкиваются лицом к лицу с судьбой.
